良种奶牛的选配，就是有目的地安排公母牛的交配组合。以期后代将双亲优良性状结合在一起，培育出优秀种牛。选配是培育优秀奶牛后代的良好前提条件。奶牛选配应该主重考虑种公牛本身的品质条件；（如体质外貌、生长发育、产奶性能等）年龄、血统和后裔等多个因素，为种牛选择最适当的配偶，才能获得更理想的后代。为了制订好选配计划和做好选配工作，应该安以下原则去做；
1、有明确的目标。根据育种目标，对奶牛的群体及个体进行生产性能和外貌调查，为巩固优良特性、改进不良性状而进行选配。
2、可根据牛个体亲和力和种群的配合力进行选配。在对过去交配结果具体分析的基础上，从中找出过去那些产生过好的后代选配组合，不但应该继续维持，而且还应增选具有相应品质的母牛与之交配。
3、选配已定的公牛生产性能与外貌等级应高于与配母牛等级。因公牛有带动和改进整个牛群的作用，而且选留数量较少，所以对其等级和质量，都应高于母牛。
4、搞好品质选配，一般情况下，优秀的公母牛采用同质选配，品质较差的母牛，在特殊的育种目的下，才采用异质选配。对改良到一定程度的牛群，不能任意用本地的公牛或低代杂种公牛来配种，这样会使改良效果退化。另外，选配时，一定要避免相同缺陷公母牛交配组合，以免加快缺点的发展。
5、控制近交，近交只宜控制在育种群必要时使用。在一般的繁殖群，远交则是一种普遍而又长期使用的方法。因此，同一公牛在一个牛群中的使用年限不能过长，应定期做好血统更新工作。一般牛群的近交系数应控制在6.25％以下为宜。
